[{"model": "dashboard.pathogendescription", "pk": 4, "fields": {"pathogen": "RSV", "lead_text": "Las muestras se recolectan en las plantas de tratamiento ubicadas en diferentes partes el estado y se analizan en nuestro laboratorio en Chicago. Los resultados se publican y actualizan semanalmente. Los números en el eje Y representan los restos virales de SARS-CoV-2 en copia del gen/litro. Las fechas en el eje X son las fechas en que se recogieron las muestras.", "details": "

Interpretación de los resultados

Los datos de vigilancia de aguas residuales son "ruidosos," es decir, muy variables. Los virus son excretados por individuos infectados con diferentes niveles de intensidad y durante diferentes períodos de tiempo. Las muestras también se toman de fuentes (p.ej. plantas de tratamiento de aguas residuales) que están sujetas a diversos impactos ambientales, como fenómenos meteorológicos y actividad industrial. Por este motivo, nos centramos en las tendencias de aumento y disminución de los datos más que en medidas específicas. Un aumento significativo a lo largo del tiempo puede indicar que los casos están aumentando en una comunidad.

Los datos de vigilancia de aguas residuales deben interpretarse siempre junto con otras métricas de salud pública.

¿Por qué hay dos puntos de datos de colores diferentes?

Los puntos de datos de diferentes colores representan dos tipos diferentes de RSV, los tipos A y B. La Influenza A y B son los tipos más comunes de virus de la gripe que infectan a los seres humanos y causan epidemias estacionales, por lo que son importantes para la salud pública.

¿Qué significa la línea?

Como los datos de aguas residuales son muy variables, incluimos una curva que se ajusta a los datos para visualizar mejor los aumentos y las disminuciones. Para ello, "suavizamos" los datos mediante el método de suavizado de dispersión ponderado localmente (LOWESS), un análisis de regresión local. Este método es útil porque reduce la influencia de los valores atípicos de los datos (p.ej. lecturas de muestras que son mucho más altas o mucho más bajas que las otras muestras tomadas en el mismo sitio durante el mismo periodo de tiempo general). También incluimos intervalos de confianza del 95% alrededor de la línea de tendencia. Esto significa que estamos seguros al 95% de que la línea de tendencia real se encuentra dentro de los intervalos.

¿Cuál es la diferencia entre una escala logarítmica y lineal?

Una escala lineal utiliza una distancia igual entre pasos en el eje vertical, añadiendo un número constante para cada nuevo paso (p.ej. 1, 2, 3, 4 o 10, 20, 30, 40). Una escala logarítmica utiliza una distancia desigual entre pasos, multiplicando por un número constante cada nuevo paso. Típicamente, como hacemos aquí, este múltiplo es 10, por lo que el eje podría mostrar pasos a 1, 100, 1000, 10.000, etc.

Las escalas logarítmicas se utilizan para visualizar datos cuando el rango de valores mostrados es grande y cuando se visualizan datos durante un periodo de tiempo más largo. Los funcionarios de Salud Pública y los científicos suelen trabajar con datos en estas escalas, mientras que las escalas lineales son más familiares para el público.

Limitaciones de los datos

En la actualidad, investigadores siguen trabajando para comprender varias cuestiones científicas abiertas, entre ellas cómo utilizar los datos para determinar el número de personas enfermas. La variabilidad entre las distintas fuentes de aguas residuales, instalaciones de tratamiento, y comunidades, dificulta la interpretación de la concentración de copias (gc) del gen RSV A/B al número de personas infectadas en la comunidad. Sin embargo, una tendencia ascendente/descendente en copias de genes por litro (gc/litro) de RSV A/B generalmente sugiere una tendencia similar en el número de personas infectadas dentro de una comunidad dada.

Por razones similares relacionadas con la variabilidad de cada muestra, también se desaconseja comparar los datos de una ubicación con otra.

Metodología

Las muestras de aguas residuales se analizan utilizando el kit GT-Digital RSV Wastewater Surveillance Kit for the QIAcuity® Digital PCR system, que consta de un kit de reactivos moleculares que contienen una solución de ensayo y un control para la cuantificacion del virus respiratorio sincitial (RSV). Los resultados se presentan en copias de genes por litro (gc/L) de aguas residuales.

Referencias

Armbruster, D.A. et al., Limit of blank, limit of detection and limit of quantitation, Clin. Biochem. Rev. 29, Suppl 1, 2008

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Interpretación de los resultados

Los datos de vigilancia de aguas residuales deben interpretarse siempre junto con otras métricas de salud pública.

¿Por qué hay dos puntos de datos de colores diferentes?

En febrero de 2022 hicimos un cambio en nuestros métodos de laboratorio para mejorar nuestra capacidad de detectar cantidades muy pequeñas del virus SARS-CoV-2 en aguas residuales. Nuestro nuevo método aumenta la cantidad de virus que podemos extraer de cada muestra. Dado que aguas residuales no sólo contienen virus (productos químicos, restos de comida, jabones, desechos humanos, etc.), puede resultar difícil aislar los virus que buscamos. El nuevo método nos ayuda a conseguirlo.

Los datos generados con el método anterior no son directamente comparables con el nuevo método.

¿Qué significa la línea?

¿Cuál es la diferencia entre una escala logarítmica y lineal?

Limitaciones de los datos

En la actualidad, investigadores siguen trabajando para comprender varias cuestiones científicas abiertas, entre ellas cómo utilizar los datos para determinar el número de personas enfermas. La variabilidad entre las distintas fuentes de aguas residuales, instalaciones de tratamiento, y comunidades, dificulta la interpretación de la concentración de copias (gc) del gen SARS-CoV-2 al número de personas infectadas en la comunidad. Sin embargo, una tendencia ascendente/descendente en copias de genes por litro (gc/litro) de SARS-CoV-2 generalmente sugiere una tendencia similar en el número de personas infectadas dentro de una comunidad dada.

Por razones similares relacionadas con la variabilidad de cada muestra, también se desaconseja comparar los datos de una ubicación con otra.

Metodología

Las muestras aguas residuales se analizan mediante la reacción en cadena de la polimerasa digital (dPCR) para determinar la concentración del virus SARS-CoV-2 en una muestra. El gen de la proteína de la nucleocápside (N) del virus es el objetivo del ensayo molecular, y los resultados se expresan en copias del gen por litro (gc/L) de agua residual.

Referencias

"}}, {"model": "dashboard.pathogendescription", "pk": 3, "fields": {"pathogen": "Influenza", "lead_text": "Las muestras se recogen en plantas de tratamiento de todo el estado y se analizan en nuestro laboratorio de Chicago. Los resultados se publican y actualizan semanalmente. Los números del eje Y representan los residuos virales de Influenza A/B en copias gen/litro. Las fechas en el eje X son las fechas en que se recogieron las muestras.", "details": "

Interpretación de los resultados

Los datos de vigilancia de aguas residuales deben interpretarse siempre junto con otras métricas de salud pública.

¿Por qué hay dos puntos de datos de colores diferentes?

Los puntos de datos de diferentes colores representan dos tipos diferentes de Influenza, los tipos A y B. La Influenza A y B son los tipos más comunes de virus de la gripe que infectan a los seres humanos y causan epidemias estacionales, por lo que son importantes para la salud pública.

¿Qué significa la línea?

¿Cuál es la diferencia entre logarítmica y lineal?

Limitaciones de los datos

En la actualidad, investigadores siguen trabajando para comprender varias cuestiones científicas abiertas, entre ellas cómo utilizar los datos para determinar el número de personas enfermas. La variabilidad entre las distintas fuentes de aguas residuales, instalaciones de tratamiento y comunidades, dificulta la interpretación de la concentración de copias (gc) del gen Influenza A/B al número de personas infectadas en la comunidad. Sin embargo, una tendencia ascendente/descendente en copias de genes por litro (gc/litro) de Influenza A/B generalmente sugiere una tendencia similar en el número de personas infectadas dentro de una comunidad dada.

Por razones similares relacionadas con la variabilidad de cada muestra, también se desaconseja comparar los datos de una ubicación con otra.

Metodología

Las muestas de aguas residuales se analizan utilizando el kit GT-Digital Influenza and SARS-CoV-2 Wastewater Surveillance Multiplex Assay Kit for the QIAcuity® Digital PCR System, que consta de un kit de reactivos moleculares que contiene todos los cebadores, sondas y controles para la vigilancia de la Influenza y el SARS-CoV-2 en aguas residuales. Los resultados se informan en copias de genes por litro (gc/L) de aguas residuales.

Referencias

Armbruster, D.A. et al., Limit of blank, limit of detection and limit of quantitation, Clin. Biochem. Rev. 29, Suppl 1, 2008

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SDD Wastewater Treatment Plant